Bioinformatics
- Domaine
- Bioinformatics
- Domain - extra
- Modelisation, simulation, biologie de synthese
- Année
- 2013
- Starting
- octobre 2013
- État
- Open
- Sujet
- Conception, modélisation et simulation in silico d'un nanosystème biologique
artificiel de diagnostic médical, programmé pour détecter des biomarqueurs et
restituer une réponse intégrée après une étape de calcul logique.
- Thesis advisor
- AMAR Patrick
- Co-advisors
- Franck MOLINA (DR CNRS, Lab. SysDiag Montpellier)
- Laboratory
- Collaborations
- Abstract
- Le but de cette thèse est de systématiser à l'aide d'outils informatiques la
conception, l'implémentation, le test et la validation de bio-calculateurs dans
le contexte du diagnostic médical. Ses objectifs sont:
. l'étude d'outils formels d'extraction automatique de circuits logiques
fonctionnels à partir des réseaux métaboliques qui se trouvent dans des
organismes vivants pour en constituer une bibliothèque réutilisable
. l'étude de la composabilité de ces circuits logiques
. l'étude de méthodes intégrées pour la conception de bio-calculateurs, leur
implémentation compte tenu de diverses contraintes (stabilité, non toxicité,
etc.) et leur validation in silico en utilisant les approches les plus
adéquates (systèmes d'équations différentielles, simulations stochastiques
"entité-centrée" ou globales)
. un volet applicatif consistant à l'issue des travaux précédemment menés à
implémenter un outil de type "BioNetCad", dédié à notre approche et intégrant
les logiciels - Context
- Objectives
- Work program
- Extra information
- Prerequisite
- Détails
sujet-these.pdf- Expected funding
- Institutional funding
- Status of funding
- Expected
- Candidates
- Marc Bouffard
- Utilisateur
- patrick.amar
- Créé
- Mercredi 30 mai 2012 11:37:01 CEST
- dernière modif.
- Lundi 18 mars 2013 11:46:17 CET
Connexion
Ecole Doctorale Informatique Paris-Sud
Directrice
Nicole Bidoit
Assistante
Stéphanie Druetta
Conseiller aux thèses
Dominique Gouyou-Beauchamps
ED 427 - Université Paris-Sud
UFR Sciences Orsay
Bat 650 - aile nord - 417
Tel : 01 69 15 63 19
Fax : 01 69 15 63 87
courriel: ed-info à lri.fr