BIOS (CNRS et INRA, Tours, équipe de Dr.Anne Poupon)
National Institute of Informatics (NII, Tokyo, Japon, équipe de Pr. Katsumi Inoeu)
Abstract
Nous nous intéressons à la construction de la topologie de réseaux biologiques décrivant les relations causales entre éléments, avec une granularité analogue à celle de SBGN, un standard pour la représentation graphique des réseaux biologiques. La topologie du réseau est construite en formalisant le raisonnement de l’expert qui déduit des relations à partir de résultats expérimentaux.
Le premier volet du travail portera sur la détermination d'un formalisme logique pour traduire le réseau, et son utilisation pour la construction de réseaux de signalisation déclenchés par différents RCPG. Le deuxième volet portera sur l'analyse du réseau, avec le calcul de plans d'expériences intéressants pour compléter éventuellement le réseau déduit. La troisième étape sera la conception d'une méthode de calcul de comparaison et de différence de réseaux, capable d’exploiter la topologie du réseau, les différents niveaux de granularité et la sémantique des arcs.
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Objectives
Work program
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Détails
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Expected
Candidates
Adrien ROUGNY
Utilisateur
Christine.Froidevaux
Créé
Jeudi 28 février 2013 22:23:57 CET
dernière modif.
Jeudi 13 juin 2013 19:00:56 CEST
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